Kirk admirális diadala Khan felett, és a Genezis bolygó megteremtése üres gyõzelmek. Spock halott, és McCoy megmagyarázhatatlanul megõrült. Aztán Sareknek, Spock apjának váratlan látogatása döbbenetes felfedezést hoz: Spock élõ esszenciája McCoyban rejtõzik.
Az egyik barátja él, a másik nem, de mindkettõ szenved, ezért Kirk megpróbál segíteni rajtuk, ellopja az U.S.S. Enterprise ûrhajót, és szembeszáll a Csillagflotta Genezis bolygót körülvevõ vesztegzárával. De a klingonok szintén tudomást szereztek a Genezisrõl, és oda igyekeznek, hogy találkozzanak Kirkkel egy halálos randevún.