A klónok háborúja végigsöpör az egész Galaxison: a jedi lovagok képtelenek fenntartani a békét. Hátrálni kénytelenek, és egyre több világ kerül a Sötét oldal uralma alá. A Köztársaságot sosem látott veszélybe sodorja a szeparatisták végtelen droidhadserege.

Anakin Skywalker és ifjú padawánja, Ahsoka veszélyes feladat végrehajtására kap megbízást: ha Jabbával folytatott tárgyalásaik sikeresek, talán új szövetségesre találnak. Dooku gróf és megbízottjai épp ezért mindent elkövetnek, hogy Anakinék kudarcot valljanak. Ezalatt a háborús frontvonalon Obi-Wan Kenobi és Yoda mester új csatába vezeti a klónokat, hogy megállítsák a sötétség terjeszkedését.