Egy hatalmas idegen szonda közeledik a Föld felé, teljesen megbénítja az õt megállítani akaró Saratogát. Ezalatt a Földön a klingon nagykövet megpróbálja meggyõzni a Föderáció nagytanácsát, hogy méltó büntetést szabjon ki Kirk kapitányra, a Genezis alkotójára, aki klingonok elpusztítására készített a fegyver szellemi atyjára. Kirk és emberei elhagyják Vulkánt a Bounty névre keresztelt klingon hajó fedélzetén. A Föld felé haladva fogják a Föderáció üzenetét: védelmi rendszereiket megsemmisítette egy ismeretlen eredetû szonda, amely megfejthetetlen üzenetetket küld és elpusztítja a légkört és az óceánokat. Spock elemzi az üzenetet és rájön, hogy nincs aki feleljen a hívásra: akiknek szólna, a púposszárnyú bálnáknak, már rég kihaltak. Kirk megkockáztatja, hogy a nap gravitációs mezejének erejét kihasználva visszautazzanak az idõben hogy bálnákat szerezzenek, hogy azok válaszolni tudjanak majd a szondának.