X professzor iskolájának mutánsai örök veszélyben élnek. A világ nem hajlandó megtanulni, hogy a különleges képességekkel rendelkezõ majdnem-emberek csupán a jó ügy érdekében alkalmazzák tudásukat. Persze, az elõítéletek nem minden alap nélküliek: egy ismeretlen ellenség - aki valószínûleg szintén rendkívüli képességekkel bír - szörnyû terrortámadást hajt végre, és ez ismét felkorbácsolja a mutánsellenes érzelmeket. William Styker, a katonatiszt, aki korábban mutánsokon kísérletezett, a leghangosabb mutáns-ellenes. Embereivel elfoglalja az iskolát, és offenzívát indít a professzor tanítványai ellen. A bajban a mutánsok a legváratlanabb helyrõl kapnak segítséget. Magneto megszökik mûanyagbörtönébõl, és szövetséget ajánl Xavier professzornak. Elég egy szikra, és kirobban az elsõ háború mutánsok és emberek között.