Donnie éles ésszel és élénk fantáziával megáldott, tipikus amerikai kamasz. Életunt bölcsessége szerint a normális élet nem más, mint egy furcsa rejtvény, amelynek megoldásáról a legtöbb felnõttnek fogalma sincs.
1988-at írunk, "elérkezett a világvége" mondja Frank, a 190 centi magas, visszataszító szörnynyúl, akit csak Donnie Darko lát. Donnie felfedezi, hogy a külsõre csendes és békés külváros, ahol szeretõ szüleivel és két lánytestvérével él, sötét titkokat rejt. Frank jelet küld Donnie-nek különleges küldetésérõl, és ígéretéhez híven nem csak éjszaka, de nappal is rendszeresen látogatja. Felfedi elõtte a világmindenség belsõ változásait, amitõl Donnie zavarttá és nyugtalanná válik.
Kis idõ múlva furcsa dolgok történnek a városban. Könyörtelenül fogy az idõ. Donnie rájön, hogy semmi sem véletlen. Az idõ és a tér eddig feltételezett határai átléphetõek. Legjobb szándéka ellenére közeli hozzátartozói élete veszélybe kerül - világossá válik számára, hogy csak õ háríthatja el a közelgõ pusztulást...